Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms