Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSKSQ9UJT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSKSQ9UJT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms