Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFF4Q9UHB7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms