Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms