Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms