Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms