Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms