Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRBP1Q9P2E9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms