Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufa8Q9DCJ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms