Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C6Q969F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms