Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP7Q93009 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP7Q93009 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP7Q93009 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP7Q93009 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP7Q93009 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP7Q93009 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
USP7Q93009 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP7Q93009 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP7Q93009 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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