Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a8Q8R4D1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a8Q8R4D1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms