Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms