Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDFY3Q8IZQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDFY3Q8IZQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms