Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4L8

C130073F10Rik, RIKEN cDNA C130073F10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130073F10RikQ8C4L8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C130073F10RikQ8C4L8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C130073F10RikQ8C4L8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms