Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms