Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NfascQ810U3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfascQ810U3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms