Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP6Q7Z6E9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBBP6Q7Z6E9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBBP6Q7Z6E9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms