Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B3Q15393 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B3Q15393 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SF3B3Q15393 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms