Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCM1Q15154 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCM1Q15154 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCM1Q15154 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms