Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1BQ14684 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1BQ14684 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms