Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YTA12YMR089C 2478 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YLR446WYLR446W 1302 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RPL13AYDL082W 600 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 PRP18YGR006W 756 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YGR293CYGR293C 462 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHR127WYHR127W 732 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YIR042CYIR042C 711 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YJL147CYJL147C 1149 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RNH201YNL072W 924 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 IZH2YOL002C 954 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 PET123YOR158W 957 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YPL261CYPL261C 309 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YBR300CYBR300C 498 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 TOS3YGL179C 1683 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 KTR7YIL085C 1554 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 ARN1YHL040C 1884 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SAS10YDL153C 1833 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MRC1YCL061C 3291 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 BDP1YNL039W 1785 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YIG1YPL201C 1386 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 IFM1YOL023W 2031 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RPL12AYEL054C 498 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 TYW3YGL050W 822 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YGL082WYGL082W 1146 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 TAN1YGL232W 870 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YGR042WYGR042W 816 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RSR1YGR152C 819 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 PCL7YIL050W 858 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 COA1YIL157C 594 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YLR346CYLR346C 306 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 CPR3YML078W 549 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 ARF3YOR094W 552 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YPR078CYPR078C 1119 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RIB5YBR256C 717 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 DSF1YEL070W 1509 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YNR073CYNR073C 1509 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YFL042CYFL042C 2025 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 NGR1YBR212W 2019 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YDR444WYDR444W 2064 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YET3YDL072C 612 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SLU7YDR088C 1149 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 GLE2YER107C 1098 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 HIS6YIL020C 786 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MNN11YJL183W 1269 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SFC1YJR095W 969 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 ATG5YPL149W 885 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 OCA5YHL029C 2040 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YTP1YNL237W 1380 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 APE1YKL103C 1545 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MAK31YCR020C-A 267 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RPS16BYDL083C 432 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 FYV1YDR024W 486 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 RUB1YDR139C 234 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 LRS4YDR439W 1044 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHL018WYHL018W 363 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 LIN1YHR156C 1023 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YIL082WYIL082W 873 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 ICS3YJL077C 396 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SEC13YLR208W 894 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 POP7YBR167C 423 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MIC60YKR016W 1623 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MDM38YOL027C 1722 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YDR015CYDR015C 240 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YJR141WYJR141W 1044 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MRPL13YKR006C 795 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YPT52YKR014C 705 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YLR317WYLR317W 435 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 CSR1YLR380W 1227 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SAM37YMR060C 984 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 UGA1YGR019W 1416 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 PXA1YPL147W 2613 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 ASK10YGR097W 3441 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 UTP18YJL069C 1785 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YGR126WYGR126W 693 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 SVP26YHR181W 687 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 IKI1YHR187W 930 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YKL177WYKL177W 339 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YNG1YOR064C 660 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 NAT3YPR131C 588 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 MEC3YLR288C 1425 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 TDA6YPR157W 1404 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO1Q08236 YHR182WYHR182W 2358 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 GAL4YPL248C 2646 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 SAP155YFR040W 3009 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 GPR1YDL035C 2886 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 VCX1YDL128W 1236 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 YDL218WYDL218W 954 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 YGL159WYGL159W 1113 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 SCM4YGR049W 564 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 YIL025CYIL025C 375 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 LDS1YAL018C 978 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 YHC1YLR298C 696 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO1Q08236 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.4 ms