Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP2Q03169 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms