Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms