Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND3P61587 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND3P61587 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND3P61587 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RND3P61587 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RND3P61587 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RND3P61587 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND3P61587 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND3P61587 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND3P61587 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND3P61587 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms