Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFDNP55196 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFDNP55196 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFDNP55196 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AFDNP55196 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFDNP55196 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFDNP55196 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFDNP55196 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFDNP55196 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFDNP55196 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFDNP55196 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AFDNP55196 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFDNP55196 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFDNP55196 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFDNP55196 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AFDNP55196 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFDNP55196 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFDNP55196 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AFDNP55196 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms