Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC3P53804 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC3P53804 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC3P53804 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC3P53804 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC3P53804 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC3P53804 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC3P53804 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC3P53804 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC3P53804 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC3P53804 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC3P53804 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC3P53804 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC3P53804 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC3P53804 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms