Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN4P51793 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms