Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATMP50440 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATMP50440 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATMP50440 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GATMP50440 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GATMP50440 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATMP50440 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATMP50440 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATMP50440 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATMP50440 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATMP50440 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GATMP50440 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATMP50440 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATMP50440 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATMP50440 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATMP50440 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATMP50440 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATMP50440 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATMP50440 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GATMP50440 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATMP50440 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms