Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms