Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms