Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THPOP40225 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THPOP40225 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THPOP40225 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THPOP40225 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THPOP40225 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THPOP40225 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THPOP40225 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THPOP40225 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THPOP40225 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THPOP40225 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THPOP40225 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THPOP40225 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THPOP40225 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THPOP40225 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THPOP40225 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THPOP40225 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THPOP40225 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THPOP40225 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THPOP40225 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THPOP40225 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THPOP40225 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THPOP40225 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THPOP40225 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THPOP40225 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THPOP40225 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms