Protein–RNA interactions for Protein: P38708

YHR020W, Putative proline--tRNA ligase YHR020W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR020WP38708 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YHL044WYHL044W 708 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YKL162CYKL162C 1209 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SPG4YMR107W 348 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PFA3YNL326C 1011 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PPG1YNR032W 1107 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 POC4YPL144W 447 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YHR202WYHR202W 1809 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 BOI2YER114C 3123 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SPS2YDR522C 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PSE1YMR308C 3270 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 UTR4YEL038W 684 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 CAX4YGR036C 720 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 BTN2YGR142W 1233 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 RFM1YOR279C 933 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 TYE7YOR344C 876 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PST1YDR055W 1335 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YMR111CYMR111C 1389 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 BUD7YOR299W 2241 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ATH1YPR026W 3636 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 HAP4YKL109W 1665 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SEC9YGR009C 1956 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 DCS1YLR270W 1053 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 DAL82YNL314W 768 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 RPC34YNR003C 954 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YPL062WYPL062W 405 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 DIM1YPL266W 957 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 COM2YER130C 1332 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 TEF1YPR080W 1377 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 TEF2YBR118W 1377 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 BRL1YHR036W 1416 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 MCM2YBL023C 2607 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 VID30YGL227W 2877 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 NRD1YNL251C 1728 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ACC1YNR016C 6702 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 MEF1YLR069C 2286 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YEL077CYEL077C 3834 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 DET1YDR051C 1005 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PFS1YHR185C 714 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 COS9YKL219W 1224 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YLL037WYLL037W 381 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 TRI1YMR233W 681 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 RNA1YMR235C 1224 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ELA1YNL230C 1140 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 HUA2YOR284W 732 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ATP20YPR020W 348 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 NUF2YOL069W 1356 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YLR108CYLR108C 1458 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SAC1YKL212W 1872 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SKM1YOL113W 1968 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YHR182WYHR182W 2358 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 CDC48YDL126C 2508 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 URC2YDR520C 2319 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 NOP58YOR310C 1536 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SNU23YDL098C 585 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PRP18YGR006W 756 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 MIC26YGR235C 702 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YJL032WYJL032W 315 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 CYC1YJR048W 330 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YLR125WYLR125W 411 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PBP2YBR233W 1242 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 GRS1YBR121C 2004 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SAG1YJR004C 1953 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 PRO2YOR323C 1371 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YDL124WYDL124W 939 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 RPN9YDR427W 1182 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 STE2YFL026W 1296 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YGL117WYGL117W 798 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SFC1YJR095W 969 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SYC1YOR179C 567 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 POP4YBR257W 840 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 STE20YHL007C 2820 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ENT2YLR206W 1842 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 GZF3YJL110C 1656 nt5.34□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 RTT106YNL206C 1368 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 SUP45YBR143C 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 BAP2YBR068C 1830 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 YDR042CYDR042C 603 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 TOS8YGL096W 831 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 RPB4YJL140W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 PGU1YJR153W 1086 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 TDA5YLR426W 981 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 SAS5YOR213C 747 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 MED8YBR193C 672 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 IKS1YJL057C 2004 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR020WP38708 CLG1YGL215W 1359 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms