Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 JEM1YJL073W 1938 nt3.91□□□□□ -1.78
AVT5P38176 HOYDL227C 1761 nt3.91□□□□□ -1.78
AVT5P38176 CLN2YPL256C 1638 nt3.91□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YLR345WYLR345W 1530 nt3.9□□□□□ -1.78
AVT5P38176 VHS3YOR054C 2025 nt3.9□□□□□ -1.78
AVT5P38176 PDR15YDR406W 4590 nt3.9□□□□□ -1.78
AVT5P38176 TEA1YOR337W 2280 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YCR100CYCR100C 951 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 UBC5YDR059C 447 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ERG25YGR060W 930 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 BGL2YGR282C 942 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 SNL1YIL016W 480 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ALB1YJL122W 528 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ELO3YLR372W 1038 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 BBP1YPL255W 1158 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ECM8YBR076W 1065 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 UGA2YBR006W 1494 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TEC1YBR083W 1461 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TRE1YPL176C 2352 nt3.9□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NUG1YER006W 1563 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MTC1YJL123C 1437 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 DAS2YDR020C 699 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NUP42YDR192C 1293 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RRP45YDR280W 918 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 HNT2YDR305C 654 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YER190C-BYER190C-B 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YFL068WYFL068W 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 PUS6YGR169C 1215 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 POL32YJR043C 1053 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 DID4YKL002W 699 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR365WYLR365W 333 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YML133W-BYML133W-B 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 HEK2YBL032W 1146 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MDG1YNL173C 1101 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TEX1YNL253W 1269 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 Q0017Q0017 162 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 AKL1YBR059C 3327 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ALG2YGL065C 1512 nt3.89□□□□□ -1.79
AVT5P38176 HUL4YJR036C 2679 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TAF5YBR198C 2397 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MMT2YPL224C 1455 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 AIR2YDL175C 1035 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 PAD1YDR538W 729 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 COG7YGL005C 840 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 EMG1YLR186W 759 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 URA4YLR420W 1095 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YNL217WYNL217W 981 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YJR015WYJR015W 1533 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YCF1YDR135C 4548 nt3.88□□□□□ -1.79
AVT5P38176 GAS4YOL132W 1416 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MNN10YDR245W 1182 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YER067C-AYER067C-A 324 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 FAU1YER183C 636 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 KEG1YFR042W 603 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RPN12YFR052W 825 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ARC1YGL105W 1131 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RFC2YJR068W 1062 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MTR2YKL186C 555 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 UPS2YLR168C 693 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NIT3YLR351C 876 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NHP6AYPR052C 282 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YBR134WYBR134W 402 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ALG9YNL219C 1668 nt3.87□□□□□ -1.79
AVT5P38176 POL12YBL035C 2118 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 SLM5YCR024C 1479 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 VID30YGL227W 2877 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 PMT4YJR143C 2289 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YHL044WYHL044W 708 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 DAL3YIR032C 588 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RSM26YJR101W 801 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 VPS71YML041C 843 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YBL062WYBL062W 381 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 MPD1YOR288C 957 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 CMR3YPR013C 954 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 OPY2YPR075C 1083 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YCL022CYCL022C 516 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TYW1YPL207W 2433 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 PUS9YDL036C 1389 nt3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.4 ms