Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPARGP37231 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGP37231 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGP37231 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGP37231 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGP37231 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGP37231 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGP37231 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms