Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKBRP32239 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCKBRP32239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKBRP32239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCKBRP32239 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms