Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC9P31274 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC9P31274 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms