Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms