Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms