Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB1P20700 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms