Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPA1P20036 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms