Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL11A1P12107 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.4 ms