Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD2P0DJD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms