Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms