Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A1BGP04217 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A1BGP04217 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
A1BGP04217 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
A1BGP04217 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
A1BGP04217 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
A1BGP04217 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
A1BGP04217 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
A1BGP04217 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
A1BGP04217 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A1BGP04217 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A1BGP04217 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A1BGP04217 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
A1BGP04217 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A1BGP04217 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A1BGP04217 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A1BGP04217 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A1BGP04217 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A1BGP04217 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A1BGP04217 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
A1BGP04217 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A1BGP04217 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A1BGP04217 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A1BGP04217 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A1BGP04217 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A1BGP04217 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A1BGP04217 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms