Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A1P02462 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms