Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFP01133 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFP01133 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFP01133 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFP01133 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFP01133 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFP01133 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFP01133 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFP01133 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFP01133 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFP01133 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFP01133 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFP01133 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFP01133 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFP01133 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFP01133 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFP01133 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFP01133 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFP01133 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFP01133 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFP01133 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFP01133 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms