Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND1O60716 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND1O60716 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND1O60716 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms