Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2O43237 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms