Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm379J3QQ19 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms